En genbeta se me adelantaron haciendo esta buena recopilación de alternativas a programas (en general alternativas libres a software propietario), es muy común que cuando uno recien migra de windows a alguna distro GNU/linux no sepa que software usar para realizar X o Y tarea, el otro problema es que no muchas personas conocen más alternativas a muchos programas que suelen usar diariamente.

En estos 4 sitios lo que podemos encontrar es algo asi como una tabla de equivalencias entre aplicaciones.

También se pueden encontrar alternativas para otros sistemas operativos como Mac OSx.

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Alternativas Libres
Osalt
Linux App Finder – Alternatives

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